Badanie biochemiczne polega na ocenie ph moczu, ciężaru właściwego oraz zawartości róznych substancji w moczu m.in glukozy, ciał ketonowych, barwników krwi, bilirubiny, urobirynogenu.

Po ocenie biochemicznej próbka moczu zostaje odwirowana i oglądamy osad moczu w którym oceniamy ilość i wygląd poszczególnych komórek (erytrocytów, leukocytów, nabłonków różnego pochodzenia - drogi wyprowadzające, pęcherz moczowy, nerki), obecność i rodzaj kryształów, obfitość flory bakteryjnej oraz ewentualnych pasożytów.